El manejo de los desechos evitaría entre otras cosas,  la molestia de la propagación de mosquitos y de malos olores en el campus, una de las molestias más percibidas.

En un ejemplo en materia de protección del medio ambiente se convertirá la Universidad Nacional (UNA) con la puesta en marcha del proyecto Desarrollo e implementación de un plan de manejo de la microcuenca del Río Pirro, que permitirá mejorar las condiciones ambientales y de salud de las comunidades de la microcuenca e incrementar la calidad de vida  de los trabajadores de la UNA y de los moradores de la cuenca.

La primera etapa del proyecto arranca en los próximos días en los laboratorios de la Escuela de Química con la separación de las aguas negras de las aguas residuales, que actualmente están mezcladas y son vertidas al Río Pirro, sin el tratamiento adecuado. En esta fase inicial también se hará un diagnóstico de las aguas residuales de los laboratorios de Química y Biología, que contienen sustancias tóxicas, para determinar cuáles son los principales desechos y cuál es el tratamiento que requieren.